47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0588 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  91.03 
 
 		 145 aa  266  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  55.81 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  52.71 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  52.41 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  52.89 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  38.98 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  40.15 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  45.45 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  33.09 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  38.41 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  36.17 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  33.57 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40.4 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  40.37 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  42.59 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  44.03 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  36.36 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  37.06 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  37.06 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  36.36 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  43.27 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  37.4 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.25 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  36.11 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  38.17 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  38.53 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  34.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  35.54 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  36.59 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  35.88 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  29.25 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  32.5 
 
 		 373 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  28.17 
 
 		 364 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  39.67 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  35.64 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  38.61 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  28.46 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  29.03 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  42.59 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  31.91 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  33.33 
 
 		 248 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  33.03 
 
 		 249 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  40.65 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  25.55 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3020  hypothetical protein  40.28 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  30.22 
 
 		 179 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>