43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3019 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  77.54 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  55.07 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  52.71 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  51.16 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  49.24 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  36.43 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  35.07 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  37.5 
 
 		 188 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  38.6 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  37.41 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  44.34 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  37.9 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  44.09 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  36.72 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  39.42 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  38.83 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  36.97 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  36.54 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  29.92 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  35.82 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  34.33 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  41.8 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  37.04 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  38.52 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  37.04 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  34.59 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  31.85 
 
 		 360 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.66 
 
 		 364 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  30.56 
 
 		 362 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  32.74 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  34.81 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  26.98 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.66 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  29.46 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  32.88 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  34.04 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  25.95 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  34.41 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  28.78 
 
 		 430 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  26.72 
 
 		 383 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>