20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5464 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  100 
 
 		 362 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  38.31 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  38.17 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  37.5 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  36.44 
 
 		 364 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  34.89 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  34.95 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  33.7 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  26.83 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  30 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  30.7 
 
 		 188 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  30.56 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  28.07 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4386  hypothetical protein  24.7 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760576  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  25.18 
 
 		 140 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  29.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  27.14 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  29.79 
 
 		 2148 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  25.55 
 
 		 145 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>