28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0380 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  100 
 
 		 360 aa  731    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  48.91 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  47.71 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  34.89 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  37.47 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  37.67 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  37.02 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  29.35 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  27.78 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  31.65 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  31.47 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  30.77 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  31.85 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  29.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4386  hypothetical protein  27.75 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760576  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  28.28 
 
 		 161 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  28.19 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  31.07 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  28.44 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  29.59 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.01 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  30.28 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  30.39 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  31.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  27.87 
 
 		 228 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>