28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1173 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  62.94 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  57.46 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  47.59 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  45.27 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32.14 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  44.76 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  36.59 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  35.04 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  35.66 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  34.96 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  33.86 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  36 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  34.62 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  32.31 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  39 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  36.11 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.87 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.4 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  32.37 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  32.77 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  37.5 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  33.91 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  26.06 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  30.94 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  35.29 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  30.53 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.3 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>