32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0564 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  100 
 
 
186 aa  358  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  49.17 
 
 
186 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  48.6 
 
 
188 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  39.67 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  33.33 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.43 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  30.43 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  26.12 
 
 
297 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  34.83 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  32.17 
 
 
138 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  35.64 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39.36 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  34.96 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  34.31 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  30.84 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  29.46 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0322  hypothetical protein  27.69 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  24.41 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  30.43 
 
 
161 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  30.36 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  35.19 
 
 
228 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  34.4 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  28.28 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  37.29 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2945  hypothetical protein  26.76 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>