18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4079 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  353  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  35.71 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  30.56 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  35.66 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  36.64 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2945  hypothetical protein  30.17 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  34.62 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  35.34 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  33.65 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  36.07 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  31.73 
 
 
188 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  36.54 
 
 
184 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  32.43 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  29.03 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  33.63 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>