45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4731 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  100 
 
 		 186 aa  352  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  49.17 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  42.61 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  32.12 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  42.74 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  40.65 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  35.48 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  35.65 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  38.14 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  30.36 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  33.91 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  33.63 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  38.1 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0322  hypothetical protein  31.48 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  26.92 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  28.79 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  36.36 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  38 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  41.35 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  32.09 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  41.35 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2945  hypothetical protein  25.53 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  44.58 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39.39 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  35.77 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  35.35 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  30.84 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  30.84 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  35.29 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  39.42 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  31.82 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  27.93 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  42.47 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  37.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  36.73 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  29.91 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  40.95 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.04 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  32.65 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1088  hypothetical protein  30.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000961517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3253  hypothetical protein  48.48 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000796104  hitchhiker  0.00083693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>