33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0805 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  295  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  62.94 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  55.15 
 
 
166 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  47.89 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  47.41 
 
 
167 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.33 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  38 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  35.78 
 
 
180 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  40.38 
 
 
228 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  40.2 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  39.5 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  36.92 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  36.92 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  34.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  37.38 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  34.29 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  37.96 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  36.29 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  32.84 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  39 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  35.77 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  33.65 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  41.35 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  41.35 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  36.19 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.94 
 
 
364 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2418  hypothetical protein  33.67 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.090846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  31.54 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  26.85 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2294  hypothetical protein  33.67 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  33.59 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>