40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1453 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  100 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  59.56 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  50.62 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  53.55 
 
 		 228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  47.44 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  46.79 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  43.51 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  42.86 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  41.29 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  45.39 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  42.36 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  51.09 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  45.14 
 
 		 151 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  36 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  42.59 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  40.74 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.8 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  37.5 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  35.51 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  39.42 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  43.97 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  30.4 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  33.64 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  35.25 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  39.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  29.25 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  29.25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02550  hypothetical protein  34.34 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  28.91 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  32.35 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  27.59 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  35.29 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  33.91 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  33.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  26.55 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  33.03 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  35.79 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>