32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2885 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  100 
 
 		 161 aa  323  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  48.44 
 
 		 140 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  43.4 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  44.03 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  48.19 
 
 		 97 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  41.79 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  44.34 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  41.8 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  46.73 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  35.09 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  35.25 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  35.77 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  36.51 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  37.39 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  31.54 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  35.4 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  38.03 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  36.52 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  33.77 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  31.82 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  32.45 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  37.25 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  35.92 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  31.25 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  38.05 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  30.71 
 
 		 193 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  38.4 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  33.07 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  36.56 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.33 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  33.64 
 
 		 228 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>