42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  100 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  54.84 
 
 		 174 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  54.84 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  62.76 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  41.29 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  45.33 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  40.24 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  43.23 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  47.86 
 
 		 228 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  44.29 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  48.91 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40.4 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  29.58 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  36.36 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.59 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  38.74 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  39.29 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  35.54 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  37.04 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.63 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30.89 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  34.48 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  37.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  34.82 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  38.32 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  40.82 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  38.46 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  40 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  27.36 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  29.41 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  30.7 
 
 		 383 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  36.96 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  21.3 
 
 		 297 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  23.19 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  25.42 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  29.63 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  22.92 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  25 
 
 		 362 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0538  hypothetical protein  29.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.325022  normal  0.281647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  30.71 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>