43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1352 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  100 
 
 		 161 aa  308  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  50.62 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  50.92 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  45.27 
 
 		 188 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  45.33 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  45.14 
 
 		 191 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  46.94 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  45.64 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  52.14 
 
 		 228 aa  94.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  45.81 
 
 		 174 aa  94  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  44.68 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  45.14 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  33.1 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  33.57 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  35.48 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  38.67 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  43.43 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  37.9 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  38.58 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.45 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  35.11 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  35.42 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.33 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.13 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  42.5 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.3 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  42.48 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  31.54 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  28.17 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  39.6 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  30.97 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  34.62 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  33.65 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  27.66 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  27.27 
 
 		 360 aa  47.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  28.74 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.82 
 
 		 364 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.43 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0538  hypothetical protein  25.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.325022  normal  0.281647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  27.45 
 
 		 362 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2479  DoxX family protein  44.78 
 
 		 363 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.030933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>