27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5708 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  42.95 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  36 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  39.31 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  38.67 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  45.07 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  40.13 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  39.33 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  39.29 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  42.47 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  38.93 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  41.18 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  34.69 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30.33 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  30.22 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  28.26 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  35.35 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  25.9 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  31.3 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  25 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  26.57 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  26.02 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  26.5 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  30.77 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  29.82 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  29.29 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>