42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2872 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  100 
 
 
228 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  53.55 
 
 
188 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  56.03 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  55.17 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  53.15 
 
 
191 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  51.08 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  48.91 
 
 
193 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  48.2 
 
 
174 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  52.14 
 
 
161 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  41.5 
 
 
188 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  37.93 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  52.21 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  37.59 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  36.92 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  37.7 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  37.61 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  35.11 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.04 
 
 
167 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  39.01 
 
 
151 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  37.74 
 
 
142 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  30.23 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  35.82 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  32.33 
 
 
159 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  34.51 
 
 
140 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  35.17 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.87 
 
 
179 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  31.65 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.87 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  29.36 
 
 
167 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  35.83 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  35.19 
 
 
186 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  31 
 
 
362 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  35.38 
 
 
97 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  34.62 
 
 
179 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  34.78 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1046  hypothetical protein  35.85 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  34.02 
 
 
383 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  33.91 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  33.91 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  37.5 
 
 
154 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  32.48 
 
 
373 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>