16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0902 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  357  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  97.71 
 
 		 297 aa  337  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  28.43 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  28.44 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  29.25 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  31.25 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  27.66 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  32.71 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  28.87 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02550  hypothetical protein  26.45 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  23.81 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3020  hypothetical protein  30.25 
 
 		 256 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  25 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  28.57 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  22.86 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  28.16 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>