35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1676 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  100 
 
 		 167 aa  326  8e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  52.86 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  47.59 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  47.41 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  41.22 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  36.72 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  34.09 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  37.82 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  35 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  35.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  35.54 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30.37 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  35.25 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  34.48 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39.8 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  35.92 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  35.51 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  29.5 
 
 		 364 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  35.19 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  32.71 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  32.35 
 
 		 188 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  32.71 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  36.36 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  31.58 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  30.22 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  29.79 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  32.86 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  35.48 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  33.01 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4386  hypothetical protein  32.95 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760576  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  30.4 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  29.55 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  24.76 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  28.71 
 
 		 362 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>