38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3388 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  48.12 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  34.48 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  45.68 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  37.41 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  36.23 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.41 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  35.48 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  30.65 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.16 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  35.24 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  33.82 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  33.93 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  32.48 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  33.33 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  37.72 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  31.5 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  32.62 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  30.37 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  31.19 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  31.78 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  34.29 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  36.89 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  34.83 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  30.89 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  30.77 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  30 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  34.75 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  35.87 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  35.87 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  31.78 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  35 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  30.33 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0538  hypothetical protein  29.89 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.325022  normal  0.281647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  30.95 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>