35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1059 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  52.86 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  47.89 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  45.27 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  45.04 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  37.1 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  35.51 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  39.84 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  30.71 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  34.59 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  38.21 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  33.59 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  33.33 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  34.33 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.21 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  31.14 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  29.92 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  33.57 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  32.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  32.87 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  33.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  37.62 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  34.31 
 
 		 373 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.54 
 
 		 364 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.53 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  33.59 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  29.6 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  29.05 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  32.17 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  27.01 
 
 		 362 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  28.32 
 
 		 142 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  31.25 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>