32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3172 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  100 
 
 		 170 aa  332  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  63.86 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  52.03 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  52 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  52 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  55.17 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  45.39 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  44.29 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  45.14 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  45.33 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  39.58 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  40.97 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  35.76 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  38.93 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  35.88 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  37.5 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  34.81 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30.95 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40.4 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  29.73 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  32.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  31.19 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.23 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.25 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  26.67 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  27.14 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  35.96 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  28.87 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  26.83 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  30.94 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>