44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1657 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  35.07 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  34.09 
 
 
138 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  34.58 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  36.17 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  35.66 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  34.75 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  35.24 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  31.54 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  32.45 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.27 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  31.97 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  35.11 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  35.54 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  29.58 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  33.33 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  30.4 
 
 
188 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  32.62 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  34.15 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  32.06 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  29.81 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.43 
 
 
186 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  31.78 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  32.81 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  36.17 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  30.08 
 
 
228 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  36.92 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  33.87 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  31.58 
 
 
167 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  34.45 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  32.12 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  29.33 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  36.89 
 
 
373 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  29.91 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  29.91 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  32.12 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  32.71 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  35.4 
 
 
161 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  30.84 
 
 
184 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  31.11 
 
 
364 aa  40.8  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>