28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0556 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  55.15 
 
 		 152 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  57.46 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  45.04 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  41.22 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  37.72 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  38.68 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  35.48 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  39.47 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  41.28 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  34.36 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  35.51 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  30.14 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  30.77 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  33.96 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  33.64 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  37.93 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  40.82 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  35.29 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  32.38 
 
 		 373 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  36.27 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  27.08 
 
 		 360 aa  44.3  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  32.35 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  32.47 
 
 		 166 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  28.28 
 
 		 364 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>