26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3819 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  337  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  42.86 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.19 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  44.23 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  39.1 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  39.1 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  37.58 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  42.14 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  34.96 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.61 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  41.82 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.32 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  37.89 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  35.51 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  34.45 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  29.91 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  31.86 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  34.26 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3253  hypothetical protein  40.56 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000796104  hitchhiker  0.00083693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  31.37 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  33.93 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>