34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4996 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  97.28 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  88.59 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  88.59 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  86.96 
 
 		 184 aa  267  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  87.5 
 
 		 184 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  76.06 
 
 		 188 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  75.65 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  39.89 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.52 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  38.71 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  29.23 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  31.71 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  35.75 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  40 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  32.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  37.39 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  34.06 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32.26 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  31.58 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  34.19 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  35.58 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  31.53 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3253  hypothetical protein  57.14 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000796104  hitchhiker  0.00083693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  36.8 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  29.85 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  31.58 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  30.97 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  31.71 
 
 		 187 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  29.13 
 
 		 140 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  35.09 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>