37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2942 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  59.56 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  50.9 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  50.92 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  56.03 
 
 		 228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  42.58 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  52.03 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  44.38 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  44.38 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  40.25 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  41.67 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  46.81 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  39.39 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  40.15 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40.14 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  39.31 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  35.09 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  31.97 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  33.59 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  38.46 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  39.84 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  31.5 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  36.54 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.33 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.97 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  28.36 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  36.29 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  28.46 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  35.94 
 
 		 97 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  30.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  36.45 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  31.03 
 
 		 373 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  31.13 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  31.58 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  36.84 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02550  hypothetical protein  30.21 
 
 		 360 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>