18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3810 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  359  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  76.06 
 
 
184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  76.06 
 
 
184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  76.6 
 
 
184 aa  227  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  76.6 
 
 
184 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  76.06 
 
 
184 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  76.06 
 
 
184 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  70.98 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  36.3 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  38.51 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  38.61 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.22 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  33.15 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  28.95 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  30.09 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  36.84 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  41.89 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  34.88 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>