32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2223 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  100 
 
 		 178 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  39.87 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  32.47 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  39.22 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  38.61 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  33.7 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  33.7 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  36.31 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  38.46 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  29.81 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  37.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  29.81 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  35.25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  36.08 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  40.71 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  34.09 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  34.39 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2945  hypothetical protein  28.23 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  31.82 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  29.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.29 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  36.88 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  35.48 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  31.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  30.3 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  39.19 
 
 		 188 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0322  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>