34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5061 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  91.85 
 
 		 184 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  96.74 
 
 		 184 aa  264  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  88.59 
 
 		 184 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  88.59 
 
 		 184 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  76.06 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  76.17 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.93 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  39.1 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  39.45 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  36 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  34.08 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  41.35 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  42.73 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  27.69 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  35.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  38.79 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  39.18 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  36.54 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  28.93 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  30.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4079  hypothetical protein  36.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  32.35 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  38.95 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  32.81 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  36.61 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  29.32 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  31.58 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  32.08 
 
 		 138 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  29.13 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  35.71 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  36.08 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  28.28 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>