35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1011 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  100 
 
 
174 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  92.53 
 
 
174 aa  294  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  54.84 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  46.79 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  44.38 
 
 
192 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  52 
 
 
170 aa  120  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  50.98 
 
 
191 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  49.57 
 
 
188 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  45.64 
 
 
161 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  43.23 
 
 
228 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  50.96 
 
 
166 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  51.08 
 
 
228 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  39.16 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  37.06 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  40.13 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  38.68 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  35.16 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  36.51 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  34.33 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  38.52 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  32.87 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  37.5 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  31.78 
 
 
140 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  34.42 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  22.86 
 
 
179 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  22.86 
 
 
297 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  29.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.37 
 
 
158 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  29.63 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  27.35 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  37.89 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>