246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1003 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  100 
 
 		 85 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  100 
 
 		 85 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  98.82 
 
 		 85 aa  176  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  98.82 
 
 		 85 aa  176  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  98.82 
 
 		 85 aa  176  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  98.82 
 
 		 85 aa  176  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  97.65 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  97.65 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  97.65 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  79.76 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  79.76 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  79.76 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  79.76 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  79.76 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  74.7 
 
 		 89 aa  139  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  73.81 
 
 		 87 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  74.7 
 
 		 85 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  72.29 
 
 		 87 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  70.24 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 87 aa  133  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 87 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 88 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 87 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  73.49 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 86 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  67.47 
 
 		 87 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  67.47 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 86 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  66.27 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  63.53 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  40.74 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  36.25 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  33.33 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  40.85 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  37.18 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.84 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  41.89 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  40 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  34.57 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  40.79 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  32.93 
 
 		 249 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  33.33 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  39.71 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  32.43 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  33.33 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.84 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  35.62 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  40 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  37.84 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  40 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  34.18 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  39.24 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  34.88 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  30.86 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  29.87 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  31.17 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  29.73 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  30.77 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  29.87 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  36 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  39.24 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  30.49 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  36 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  32.47 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>