227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2733 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 88 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 88 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  86.21 
 
 		 87 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  86.05 
 
 		 89 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  86.75 
 
 		 85 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 92 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 88 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 88 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  80 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  80 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  80 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  80 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  78.82 
 
 		 86 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  79.07 
 
 		 87 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 85 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  72.94 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  74.39 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 86 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 86 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 85 aa  133  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  71.08 
 
 		 85 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  69.88 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  71.25 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  69.88 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  69.88 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  69.88 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  69.88 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  69.88 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  69.88 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  128  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  39.74 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.44 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  36.84 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  39.19 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  37.04 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  37.84 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  36.36 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  39.19 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.47 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  41.03 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  36.49 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.04 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  33.78 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  41.1 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  31.76 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  36.36 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  30.12 
 
 		 249 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  36.36 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  40.54 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.97 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  43.06 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  35.9 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  33.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  32.91 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  32.91 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  38.36 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  31.08 
 
 		 83 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  33.77 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  37.18 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  37.18 
 
 		 85 aa  48.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  30.95 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>