224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1641 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  100 
 
 		 87 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  90.7 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  90.7 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  90.7 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  90.7 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  90.7 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  90.8 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  95.18 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  91.86 
 
 		 89 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  89.66 
 
 		 88 aa  166  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  88.51 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  86.21 
 
 		 87 aa  163  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  87.21 
 
 		 92 aa  161  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  82.93 
 
 		 86 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  82.93 
 
 		 86 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  82.93 
 
 		 86 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 87 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  82.93 
 
 		 86 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 88 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  81.71 
 
 		 86 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  80.49 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  80.49 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  80.49 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  80.49 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  80.23 
 
 		 88 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  79.27 
 
 		 85 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  76.83 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  73.56 
 
 		 89 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  76.83 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 86 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  78.05 
 
 		 86 aa  140  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 90 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  73.81 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  73.81 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  74.39 
 
 		 86 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  72.62 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  72.62 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  72.62 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  72.62 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  72.62 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  72.62 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  71.43 
 
 		 85 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  130  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  37.97 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  37.97 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.53 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  36.49 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  36.49 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  32.5 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  35.44 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  34.12 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.43 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  36 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  36.49 
 
 		 246 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  39.24 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  39.44 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  36.25 
 
 		 247 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  29.73 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  36.36 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  40.54 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  36.49 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.18 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  34.21 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  37.66 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  40.51 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  37.66 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  29.73 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  32.43 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  37.18 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  35.9 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  36 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  35.53 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  35.9 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.62 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  40.85 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  35.9 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  40 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  29.17 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>