233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2081 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  100 
 
 		 86 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  84.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  85.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  85.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  84.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  84.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  84.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  85.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  85.88 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 86 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 89 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  78.82 
 
 		 88 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 85 aa  147  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 88 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  78.05 
 
 		 87 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  78.05 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  76.47 
 
 		 88 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 87 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  74.12 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  71.26 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  74.39 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  67.06 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 88 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 85 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 85 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  66.67 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  65.85 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  65.85 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  65.85 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  46.25 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.94 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  36.9 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  36.9 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  31.58 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  33.33 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.8 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  34.21 
 
 		 246 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  36.9 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32.14 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.52 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.14 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  33.77 
 
 		 247 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.14 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  33.77 
 
 		 247 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  32.91 
 
 		 247 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  36.59 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  33.73 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.67 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  36.9 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  34.94 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  31.17 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  31.17 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  31.17 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  31.08 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  34.52 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  37.21 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  30.59 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>