187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1466 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  86.05 
 
 		 86 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  80 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  146  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  76.47 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  76.47 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  76.47 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  76.47 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 89 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  74.12 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  74.39 
 
 		 85 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  74.39 
 
 		 87 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 92 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  73.17 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  71.76 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  71.76 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  70.73 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  70.73 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  67.07 
 
 		 88 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  65.88 
 
 		 90 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  72.5 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  65.85 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  63.41 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  63.41 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  63.41 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  62.2 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  38.75 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  33.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.37 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.15 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  27.71 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  31.71 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.93 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  30.49 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  29.49 
 
 		 247 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 		 212 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  35.44 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  31.71 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  31.71 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  41.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  31.71 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  35.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  32.93 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  31.71 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  33.75 
 
 		 248 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  31.65 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  31.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  31.51 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  31.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  31.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>