202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0597 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  100 
 
 
87 aa  179  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  71.26 
 
 
87 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  71.26 
 
 
87 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  71.26 
 
 
87 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  71.26 
 
 
87 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  71.26 
 
 
87 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  76.25 
 
 
85 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
87 aa  130  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
87 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
87 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  69.41 
 
 
88 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
87 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  69.41 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  68.24 
 
 
87 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  69.41 
 
 
88 aa  127  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  72.5 
 
 
86 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  66.67 
 
 
86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  68.24 
 
 
87 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  70 
 
 
86 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
86 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  70 
 
 
86 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  70 
 
 
86 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  70 
 
 
86 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  65.52 
 
 
89 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  67.06 
 
 
88 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  64.71 
 
 
85 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  64.71 
 
 
85 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  64.71 
 
 
85 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  68.75 
 
 
86 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  64.71 
 
 
85 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  68.75 
 
 
86 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  68.75 
 
 
86 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  68.75 
 
 
86 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  68.75 
 
 
86 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  65.88 
 
 
88 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  63.53 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  63.53 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  63.53 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  63.53 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  63.53 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  65 
 
 
89 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  65 
 
 
85 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  63.75 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  66.67 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  60.49 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  38.75 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.75 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  37.97 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  37.97 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  36.14 
 
 
212 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  39.74 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  35.44 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  36.71 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  40.79 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  35.53 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  40.79 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.47 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  38.16 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36.71 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  36.71 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  36.84 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  38.75 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36.71 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  40.51 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  34.48 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  33.75 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.79 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  34.18 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  33.33 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  28.57 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  35 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  35 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.71 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  33.75 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  36.71 
 
 
247 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  36.36 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  36.99 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  29.63 
 
 
248 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  34.18 
 
 
243 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  31.65 
 
 
83 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
83 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
83 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
83 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
83 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>