234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2403 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  100 
 
 
84 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  41.98 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  41.98 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  41.98 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  41.98 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  41.98 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  46.25 
 
 
86 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  40.74 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  40.74 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  40.74 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  40.74 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  40.48 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  39.74 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  40 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  39.74 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  39.74 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  39.74 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  39.74 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  40.48 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  38.46 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  38.75 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  39.51 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  41.98 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  38.75 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  38.75 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  42.5 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  43.59 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  43.59 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  43.59 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  38.75 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  43.59 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  37.18 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  42.31 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  43.59 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  40.7 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  39.51 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  38.36 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.8 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  34.21 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.99 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  39.74 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  35.62 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.53 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.89 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  32.93 
 
 
95 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  29.87 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  31.88 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32.89 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  35.06 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  35.06 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  39.44 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  34.25 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  35.9 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0884  glutaredoxin  29.49 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  34.21 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  29.58 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  29.87 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.89 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  31.58 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
84 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  34.25 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  32.88 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  33.78 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  29.87 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  29.87 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.89 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  29.87 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  34.25 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  34.25 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  29.87 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  33.8 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  32.39 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  32.47 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  34.18 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>