171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2090 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  100 
 
 		 86 aa  176  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  86.05 
 
 		 86 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  82.56 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 86 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  82.35 
 
 		 88 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  80.23 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  80.23 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  80.23 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  80.23 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  80 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  76.74 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  78.05 
 
 		 85 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  78.05 
 
 		 87 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  78.05 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  75.29 
 
 		 88 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 87 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 87 aa  135  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  75.61 
 
 		 87 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  74.39 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  71.95 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  65.88 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  68.29 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  69.51 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  71.25 
 
 		 87 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  64.63 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  62.2 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  39.51 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  36.59 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.37 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  27.71 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  30.49 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  29.27 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  29.27 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  29.76 
 
 		 212 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  31.71 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  34.94 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  27.5 
 
 		 249 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  29.27 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  33.77 
 
 		 247 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  29.27 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  33.77 
 
 		 247 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  29.27 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  30.23 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  30.12 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  34.21 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  30.86 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  32.05 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  25.97 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  33.73 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  38.36 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  29.27 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  28.57 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  30.23 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  28.57 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>