220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2727 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  100 
 
 		 89 aa  184  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  94.19 
 
 		 89 aa  170  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  90.59 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  89.53 
 
 		 86 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  88.37 
 
 		 86 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  88.37 
 
 		 86 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  88.37 
 
 		 86 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  88.37 
 
 		 86 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  89.41 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  89.41 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  89.41 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  89.41 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  86.36 
 
 		 88 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  83.72 
 
 		 86 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  81.4 
 
 		 86 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  76.83 
 
 		 87 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  77.65 
 
 		 86 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  74.39 
 
 		 85 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 90 aa  140  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 87 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  72.94 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  72.94 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  72.94 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  71.59 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  71.76 
 
 		 88 aa  137  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  73.17 
 
 		 87 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  70.59 
 
 		 88 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  71.95 
 
 		 88 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  68.29 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  69.51 
 
 		 88 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  63.41 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  62.2 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  62.2 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  62.2 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  62.2 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  62.2 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  62.2 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  60.98 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  63.75 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  41.98 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  39.73 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  39.73 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  32.53 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.52 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.52 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  35.06 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  35.06 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  30.95 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  29.76 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  38.2 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  30.95 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  29.87 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32.05 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32.05 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  32.91 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  28.05 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.88 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  34.18 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  30.95 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  35.06 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  28.74 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  35.71 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  29.76 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  27.71 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  32.31 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  31.33 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  36.59 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  34.21 
 
 		 248 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  30.49 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  30.77 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  32.14 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>