206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1823 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  100 
 
 
90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2560  glutaredoxin 1  72.73 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  71.91 
 
 
89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  72.94 
 
 
85 aa  141  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
89 aa  140  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  75.61 
 
 
87 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  76.83 
 
 
87 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  76.83 
 
 
87 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  76.83 
 
 
87 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  76.83 
 
 
87 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  76.83 
 
 
87 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  74.39 
 
 
85 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2534  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110269  hitchhiker  0.000286803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1746  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
86 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  70.59 
 
 
89 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2081  glutaredoxin 1  67.06 
 
 
86 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.477832  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  71.95 
 
 
92 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
87 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
87 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2648  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
87 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  70.73 
 
 
87 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  70 
 
 
88 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  70 
 
 
88 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2090  glutaredoxin 1  65.88 
 
 
86 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00518827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  70 
 
 
87 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  71.25 
 
 
88 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1466  glutaredoxin 1  65.88 
 
 
86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00232657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  67.07 
 
 
85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  67.07 
 
 
85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.288339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  65.85 
 
 
85 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  65.85 
 
 
85 aa  123  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  65.85 
 
 
85 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  65.85 
 
 
85 aa  123  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  65.85 
 
 
85 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  65.85 
 
 
85 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  64.63 
 
 
85 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  60.49 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2403  glutaredoxin 1  40.48 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  31.51 
 
 
92 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  39.19 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  30.86 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.1 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32.1 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  37.8 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  32.1 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  32.1 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  34.29 
 
 
249 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  32.93 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  28.92 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  28.92 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  32.1 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  35 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  36.59 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  32.1 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  35.14 
 
 
406 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  30.86 
 
 
83 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  32.53 
 
 
85 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  31.76 
 
 
212 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  35.62 
 
 
88 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  30 
 
 
84 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36.62 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36.62 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  32.18 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36.62 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36.62 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  30.86 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36.62 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  31.33 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32.05 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  39.73 
 
 
247 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  29.63 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  31.33 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  30.99 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  30.86 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32.05 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  43.24 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  32.53 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  32.5 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  36.49 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  31.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.73 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  43.24 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0884  glutaredoxin  32.1 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  37.35 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  28.95 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  35.38 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>