More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_2002 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  69.19 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  67.96 
 
 		 207 aa  304  9.000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  66.34 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  67.32 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  47.42 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  52.06 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  46.23 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  44.79 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  42.71 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  41.62 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  41.11 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  43.02 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  41.36 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  43.02 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  42.46 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  40.74 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  36.46 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  42.37 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  38.83 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  41.34 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  36.92 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  40.44 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  37.7 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  35.9 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  35.38 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  34.36 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  40.22 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  42.44 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  40.32 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  41.27 
 
 		 293 aa  143  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  34.92 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.06 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  27.05 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  44.93 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  26.39 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  25.6 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  39.36 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  25.6 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  24.32 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  35.53 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  41.18 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  37.8 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  35.37 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  24.54 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  42.65 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  35.37 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  41.18 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  37.35 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  23.35 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  40.3 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  34.48 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  24.05 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  24.59 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  34.21 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  22.69 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23.08 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  36.23 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  36.23 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  38.67 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  37.31 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  23.38 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  46.77 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  32.89 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  37.88 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  40.96 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  37.31 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  34.94 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  36.25 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0051  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0293672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  26.63 
 
 		 343 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  36.47 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  23.76 
 
 		 421 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  42.03 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  33.33 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  26.63 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  37.31 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  36.14 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  26.63 
 
 		 301 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  36.96 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  36.05 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  35.96 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  43.75 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  43.75 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  33.72 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  22.28 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  42.11 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  36.25 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  39.02 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  37.8 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  37.5 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  39.02 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  33.75 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1066  30S ribosomal protein S2  37.8 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1013  30S ribosomal protein S2  37.8 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000151526  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  37.5 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  23.87 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3790  30S ribosomal protein S2  37.8 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  31.94 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  37.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>