More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1380 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  74.31 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  72.27 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  71.88 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  68.98 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  71.26 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  71.76 
 
 		 253 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  70.63 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  68.75 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  73.33 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  68.75 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  68.75 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  68.32 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  69.23 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  67.89 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  67.87 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  70.04 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  63.83 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  67.06 
 
 		 332 aa  363  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  68.7 
 
 		 349 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  63.08 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  63.08 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  68.18 
 
 		 355 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  68.72 
 
 		 276 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  63.67 
 
 		 354 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  68.31 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  65.58 
 
 		 349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  68.24 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  65.22 
 
 		 251 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  67.21 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  65.22 
 
 		 253 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  64.18 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  65.22 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  63.2 
 
 		 262 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  67.92 
 
 		 256 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  60.84 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  58.1 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  63.86 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0460  30S ribosomal protein S2  61.69 
 
 		 250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1369  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 251 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  53.41 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  58.67 
 
 		 242 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  60.44 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  54.04 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.72 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  54.01 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  51.81 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  55 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  52.3 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  51.29 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  58.11 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 251 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 283 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.46 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  61.09 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  55.06 
 
 		 241 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 241 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  56.89 
 
 		 243 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  57.32 
 
 		 267 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 		 241 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  56.31 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  51.45 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  59.01 
 
 		 235 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 295 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  54.66 
 
 		 241 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0162  30S ribosomal protein S2  55.47 
 
 		 241 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00314588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0171  30S ribosomal protein S2  55.47 
 
 		 241 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0173  30S ribosomal protein S2  55.47 
 
 		 241 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  50.37 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00167  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00889913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 251 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  59.46 
 
 		 233 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  58.11 
 
 		 274 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 241 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  48.69 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  52.99 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1066  30S ribosomal protein S2  57.01 
 
 		 241 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  57.01 
 
 		 241 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>