More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1848 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  66.53 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  68.28 
 
 		 262 aa  331  9e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  68.28 
 
 		 260 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 257 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  60.55 
 
 		 257 aa  318  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 		 252 aa  315  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  62.55 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  57.95 
 
 		 271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  59.18 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 232 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  56.86 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  56.3 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  61.18 
 
 		 262 aa  311  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 244 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 235 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  63 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  58.05 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  58.05 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  60.35 
 
 		 244 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.09 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  56.18 
 
 		 257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  61.23 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 235 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  55.68 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  55.28 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  55.68 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  55.91 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  56.18 
 
 		 256 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  56.97 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  59.91 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  60.79 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  57.81 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  50.91 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  55.65 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  52.85 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 		 265 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  50.53 
 
 		 281 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  51.63 
 
 		 264 aa  291  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  56.22 
 
 		 251 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 236 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  53.42 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  55.24 
 
 		 304 aa  289  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  54.83 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 256 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  56.43 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  58.77 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  58.77 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  52.92 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  52.92 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  50.52 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  54.66 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  53.25 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  50.41 
 
 		 245 aa  279  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 230 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  50.41 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  49.64 
 
 		 301 aa  278  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 261 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  50 
 
 		 245 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 238 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 234 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 234 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 262 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  55.46 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  54.39 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 239 aa  275  7e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  51.98 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  52.42 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  52.23 
 
 		 254 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  55.66 
 
 		 250 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  53.11 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  54.26 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 314 aa  271  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 264 aa  272  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  51.04 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  53.95 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  50.94 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>