More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1302 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  61.34 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  58.46 
 
 		 202 aa  244  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 		 247 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  57.44 
 
 		 263 aa  243  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  57.44 
 
 		 269 aa  242  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  58 
 
 		 205 aa  237  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  55.05 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  56.12 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  55.33 
 
 		 259 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  56.57 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  54.77 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  56.85 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  54.36 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  55.33 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  50.75 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  49.48 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  51.04 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  49.48 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  49.75 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  48.24 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  46.73 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  46.73 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  48.37 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  42.71 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  43.09 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  45.45 
 
 		 293 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  42.31 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  38.95 
 
 		 292 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.65 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  26.67 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  26.67 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  30.09 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  25.78 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  29.77 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  27.06 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  28.24 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  27.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  27.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  27.19 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  27.78 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  28.38 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  27.05 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  28.7 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  26.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  27.1 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  25.93 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  28.63 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  25.7 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  26.17 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  26.73 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  26.81 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  27.88 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  25.93 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  26.39 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  26.27 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  26.46 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  24.07 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  26.07 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  26.73 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  25.93 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  25.46 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  25.46 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  26.85 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  27.85 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  26.85 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  25.93 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  26.85 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  26.76 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  23.68 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  27.31 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  26.96 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  25.32 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  25.82 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3517  ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 420 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  25.46 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  25.68 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  26.27 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  27.06 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  25.84 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  22.34 
 
 		 421 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  27.4 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 314 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>