More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf061 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  45.7 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  43.86 
 
 		 233 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  44.8 
 
 		 257 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  43.42 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  44 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  45.25 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  42.86 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  41.77 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  43.81 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  43.69 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  42.54 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  44.16 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  42.79 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  44.8 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  45.13 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  44.2 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  42.48 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  43.29 
 
 		 260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  43.29 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  41.85 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  40.69 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  44.89 
 
 		 246 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  41.88 
 
 		 235 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  44.89 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  42.24 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  42.15 
 
 		 262 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  41.59 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  41.13 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  41.26 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  41.56 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  42.48 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  42.48 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  42.19 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  39.61 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  43.44 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  40.69 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  40.5 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  38.49 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  38.49 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  40 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  42.27 
 
 		 267 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  40.27 
 
 		 289 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  42.98 
 
 		 251 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  36.67 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  42.48 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  37.19 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  41.59 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  42.04 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  39.11 
 
 		 242 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  40.79 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  41.44 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  41.13 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  41.15 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  40.36 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  40.69 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  42.86 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  42.86 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  41.52 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  40.69 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  41.89 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  42.67 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  42.79 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  44 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  43.36 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  41.67 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  41.82 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  39.06 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  39.06 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  41.52 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  39.93 
 
 		 269 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  43.69 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  41.2 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  42.33 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  42.54 
 
 		 232 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  42.01 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  42.22 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  42.01 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  41.13 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  36.96 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  42.92 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1270  30S ribosomal protein S2  40.53 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00260886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  39.91 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>