More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1648 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  85.88 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  85.66 
 
 		 253 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  85.89 
 
 		 252 aa  440  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  84.9 
 
 		 256 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2013  30S ribosomal protein S2  83.04 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  80.09 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  57.09 
 
 		 274 aa  299  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3037  30S ribosomal subunit protein S2  53.82 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000399073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0882  ribosomal protein S2  60.93 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  56.03 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  53.17 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  54.47 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  57.66 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  54.44 
 
 		 267 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  54.98 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  54.3 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  57.6 
 
 		 343 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  53.62 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  57.6 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  54.62 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  57.6 
 
 		 301 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 315 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0723  30S ribosomal protein S2  53.64 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  54.87 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  54.95 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  53.21 
 
 		 248 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  55.11 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  52.42 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  51.39 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  53.11 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  53.1 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  50.21 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  49.56 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2548  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.443564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  53.04 
 
 		 243 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1146  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0350  30S ribosomal protein S2  50.2 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.20969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  53.28 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 296 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0389  30S ribosomal protein S2  50.2 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0342077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4082  30S ribosomal protein S2  55.31 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.610461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  50.4 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1534  ribosomal protein S2  55.31 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1483  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1591  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1101  30S ribosomal protein S2  55.31 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  51.77 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4186  30S ribosomal protein S2  54.42 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  51.77 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  50.89 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  52.28 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  52.44 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  54.87 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  52.84 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  48.59 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  48.79 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  50.6 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00167  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00889913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  51.04 
 
 		 241 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  53.71 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  49.37 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  51.87 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 282 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  51.45 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  51.45 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  51.45 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>