More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1238 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  80.43 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  78.45 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  79.22 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  68.28 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  70.04 
 
 		 233 aa  338  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  66.39 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  70.04 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  65.71 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  64.66 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  67.08 
 
 		 235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 		 235 aa  331  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  73.25 
 
 		 243 aa  330  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  67.98 
 
 		 232 aa  329  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  66.24 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  61.11 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  62.75 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  67.71 
 
 		 248 aa  325  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  63.79 
 
 		 244 aa  324  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  61.54 
 
 		 255 aa  323  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 281 aa  323  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  64.49 
 
 		 252 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  61.54 
 
 		 255 aa  323  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  65.64 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  65.64 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  63.03 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  64.83 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  65.92 
 
 		 289 aa  319  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 246 aa  317  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  59.51 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 255 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  65.18 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  64.32 
 
 		 236 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  60.08 
 
 		 257 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  62.08 
 
 		 315 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  58.23 
 
 		 257 aa  305  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  59.76 
 
 		 304 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 301 aa  304  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  62.33 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  59.83 
 
 		 280 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  62.67 
 
 		 274 aa  301  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  57.65 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  62.73 
 
 		 301 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  58.1 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  58.96 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  54.58 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  59.38 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  55.77 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  58.59 
 
 		 265 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 260 aa  294  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  58.59 
 
 		 264 aa  293  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  55.92 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  61.71 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  55.92 
 
 		 300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  53.7 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  55.92 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  57.71 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  54.09 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  54.22 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  51.91 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  58.93 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  55.13 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  57.38 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  56.72 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 		 271 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  59.38 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  56.25 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  54.37 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  56.7 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  53.63 
 
 		 304 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>