More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1672 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 233 aa  476  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 233 aa  476  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  78.54 
 
 		 252 aa  377  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  77.59 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  73.82 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  72.96 
 
 		 238 aa  358  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  71.93 
 
 		 233 aa  352  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  70.31 
 
 		 248 aa  351  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  71.12 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  69.83 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  71.05 
 
 		 262 aa  347  8e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  70 
 
 		 235 aa  347  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  68.53 
 
 		 244 aa  346  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  70.43 
 
 		 233 aa  346  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  69.1 
 
 		 232 aa  345  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  70.13 
 
 		 236 aa  345  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  70 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  70 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  69.74 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  69.74 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  69.83 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  69.57 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  71.05 
 
 		 244 aa  340  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  69.1 
 
 		 246 aa  332  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  67.81 
 
 		 255 aa  331  7.000000000000001e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  66.52 
 
 		 271 aa  328  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  65.5 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  64.66 
 
 		 280 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  66.08 
 
 		 251 aa  318  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  63.36 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  65.09 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  64.81 
 
 		 262 aa  318  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  65.33 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 255 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  64.66 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  61.04 
 
 		 256 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  62.93 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  62.28 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 260 aa  309  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  64.04 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 301 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  62.67 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  62.67 
 
 		 314 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  63.11 
 
 		 315 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  65.5 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  64.63 
 
 		 256 aa  297  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  63.35 
 
 		 301 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 304 aa  295  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  60.26 
 
 		 260 aa  293  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  60.44 
 
 		 289 aa  291  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  57.64 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  60.87 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  58.77 
 
 		 288 aa  285  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 271 aa  285  5.999999999999999e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  58.55 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  59.56 
 
 		 300 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  57.64 
 
 		 272 aa  282  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 257 aa  278  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 316 aa  278  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  55.02 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  56.78 
 
 		 262 aa  276  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  54.94 
 
 		 264 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  58.85 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 317 aa  275  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 284 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 284 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 284 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  57.64 
 
 		 353 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 304 aa  274  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 279 aa  274  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  55.26 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 283 aa  274  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 314 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 		 292 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 303 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  56.33 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 283 aa  271  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>