More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1780 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 243 aa  496  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  84.15 
 
 		 251 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  67.36 
 
 		 264 aa  348  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.72 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 244 aa  284  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  57.4 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  54.94 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  56.65 
 
 		 233 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  56.65 
 
 		 233 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  56.65 
 
 		 233 aa  281  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  55.33 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  57.46 
 
 		 260 aa  279  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  57.46 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  54.46 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  50.62 
 
 		 246 aa  275  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  52.77 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 353 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  58.15 
 
 		 243 aa  274  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  54.63 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  52.26 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  53.98 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  52.12 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  54.78 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  52.92 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  53.25 
 
 		 284 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  53.25 
 
 		 284 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  53.25 
 
 		 284 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  55.07 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  53.48 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  53.48 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  53.88 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  55.02 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  52.1 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  53.48 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  52.92 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  53.25 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  52.32 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  54.59 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  52.42 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  51.54 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  51.54 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  52.38 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  51.44 
 
 		 326 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 273 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  53.04 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  53.09 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  51.1 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  56.54 
 
 		 278 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  50.62 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  52.61 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  51.45 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  53.51 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  53.12 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  51.1 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  54.22 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  57.33 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 289 aa  262  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  52.86 
 
 		 262 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  50 
 
 		 318 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  53.06 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  53.68 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  50.67 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  52.19 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  52.61 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  52.65 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  50.63 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>