More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  100 
 
 		 318 aa  651    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  71.61 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  71.1 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  68.65 
 
 		 311 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  78.99 
 
 		 317 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  78.52 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  76.77 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  75.69 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  77.43 
 
 		 283 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  74.32 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  75.69 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  67.09 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  70.07 
 
 		 307 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1863  Ribosomal protein S2-like protein  76.38 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  69.23 
 
 		 282 aa  407  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  71.06 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  73.61 
 
 		 283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  67 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  73.15 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  71.21 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  76.36 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  68.18 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  71.54 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  75.38 
 
 		 294 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  68.15 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  71.32 
 
 		 300 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  68.15 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  68.15 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  73.85 
 
 		 291 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  67.39 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  66.55 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  63.97 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  64.9 
 
 		 316 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  76.65 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  66.31 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  68.66 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0809  ribosomal protein S2  64.23 
 
 		 272 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0403  30S ribosomal protein S2  65.23 
 
 		 281 aa  345  7e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000078779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  63 
 
 		 233 aa  311  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  62.16 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  62.16 
 
 		 235 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.72 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  61.67 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 232 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  63 
 
 		 232 aa  302  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  56.35 
 
 		 255 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  56.35 
 
 		 255 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  63.64 
 
 		 244 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  61.33 
 
 		 257 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 233 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  60 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 236 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  59.13 
 
 		 257 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  56.61 
 
 		 233 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  58.62 
 
 		 251 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  59.46 
 
 		 233 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  59.91 
 
 		 238 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  58.22 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  55.6 
 
 		 257 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  61.43 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  58.59 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  57.58 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  58.05 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  58.05 
 
 		 255 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  52.72 
 
 		 257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  54.51 
 
 		 289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  60.61 
 
 		 243 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  57.76 
 
 		 256 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  56.83 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  55.84 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  48.89 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  58.41 
 
 		 250 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  50.71 
 
 		 262 aa  278  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  56.95 
 
 		 262 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  58.56 
 
 		 280 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  55.41 
 
 		 246 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  55.98 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 289 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  54.11 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  54.35 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  55.97 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  52.57 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  52.57 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  57.27 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  49.49 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  56 
 
 		 261 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 263 aa  271  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>