More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1103  ribosomal protein S2  85.46 
 
 		 278 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  unclonable  9.34188e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  74.8 
 
 		 294 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  65.06 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  58.54 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  62.22 
 
 		 233 aa  308  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 		 235 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.97 
 
 		 301 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  62.78 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  63.35 
 
 		 300 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  58.63 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  57.09 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  62.45 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  57.6 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  62.44 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  60.71 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 316 aa  296  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  59.05 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  61.54 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  61.71 
 
 		 303 aa  295  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  61.06 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  56.72 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  55.95 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  56.8 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 296 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  54.65 
 
 		 283 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  56.8 
 
 		 281 aa  291  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1415  ribosomal protein S2  61.26 
 
 		 311 aa  291  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  56.97 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  62.16 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  56.33 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  53.7 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  59.55 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  57.79 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  59.57 
 
 		 353 aa  289  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  60.83 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  58.93 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  55.87 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  58.93 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  58.93 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  58.48 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  58.62 
 
 		 232 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3243  SSU ribosomal protein S2P  57.55 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  59.38 
 
 		 344 aa  286  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  60.81 
 
 		 292 aa  286  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  55.79 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  60.44 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  60 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  57.85 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  58.62 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  55.46 
 
 		 280 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  56.97 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2198  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 297 aa  284  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0626  ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.761856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06740  30S ribosomal protein S2  61.35 
 
 		 285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11190  SSU ribosomal protein S2P  55.42 
 
 		 310 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  55.36 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  55.23 
 
 		 289 aa  281  5.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10120  SSU ribosomal protein S2P  52.92 
 
 		 318 aa  281  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  55.69 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  54.13 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 314 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  55.1 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1367  30S ribosomal protein S2  59.68 
 
 		 294 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.480409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  56.05 
 
 		 343 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 236 aa  278  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  51.15 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  52.85 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  56.56 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  61.26 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1384  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000357638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 263 aa  274  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  56.11 
 
 		 315 aa  274  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>